1)、白色木化石
　　礦物純凈度高，粒度均勻，組成單一，細(xì)胞殘留色淺，細(xì)胞壁殘留物極少，細(xì)胞形態(tài)主要從石英、玉髓交代、充填、堆積形成的細(xì)胞輪廓判斷。樹種多以水杉，銀杏等非產(chǎn)樹脂性植物為主，后期浸染作用微弱。白色木化石較少見。
　　2)、灰色木化石
　　礦物純凈度高，粒度均勻，組成單一，細(xì)胞殘留色深，細(xì)胞壁殘留物較多，細(xì)胞形態(tài)主要從石英、玉髓交代、充填、堆積形成的細(xì)胞輪廓及明顯的細(xì)胞壁判斷。樹種多以水杉，銀杏等非產(chǎn)樹脂性植物為主，后期浸染作用較強�；疑�木化石常見��
　　3)、黃色木化石
　　礦物純凈度高，粒度均勻組成單一，細(xì)胞殘留色深，細(xì)胞壁殘留物較多，細(xì)胞形態(tài)主要從石英、玉髓、蛋白石交代、充填、堆積形成的細(xì)胞輪廓及明顯的細(xì)胞壁判斷。樹種多以松，柏等產(chǎn)樹脂性植物為主，黃色在木化石中分布均勻，里、外一致，與原始木質(zhì)相關(guān)，黃色木化石常見。 另一種黃色木化石。由于Fe2O3的黃色礦物相的浸染作用，使木化石呈顯黃色，這種黃色是不均一的，有淺深之分。
　　4)、褐色木化石
　　礦物純凈度高，粒度均勻組成單一，后期氧化鐵質(zhì)浸染并深入細(xì)胞，殘留色淺―深，細(xì)胞壁殘留物少―較多，細(xì)胞形態(tài)主要從石英、玉髓、蛋白石交代、充填、堆積形成的細(xì)胞輪廓及明顯的細(xì)胞壁判斷。各樹種均有。
　　受Fe2O3的褐色礦物相浸染，使木化石呈顯褐色。在木化石中整體呈褐色者少見，大多數(shù)呈斑塊狀、花斑狀或一團(tuán)團(tuán)的分布。

　　5)、紅色木化石
　　礦物純凈度高，粒度均勻組成單一，后期氧化鐵質(zhì)浸染并深入細(xì)胞，殘留色淺―深，細(xì)胞壁殘留物少―較多，細(xì)胞形態(tài)主要從石英、玉髓、蛋白石交代、充填、堆積形成的細(xì)胞輪廓及明顯的細(xì)胞壁判斷。各樹種均有。
　　受Fe2O3的紅色礦物相浸染，使木化石呈顯紅色。在木化石中整體呈紅色者少見，大多數(shù)呈斑塊狀、花斑狀或一團(tuán)團(tuán)的分布，當(dāng)木化石中充填、交代物為玉髓質(zhì)時，常展現(xiàn)一種似瑪瑙狀的外貌。
　　6)、綠色木化石
　　礦物純凈度高，粒度均勻組成單一，后期CuC03質(zhì)浸染并深入細(xì)胞，殘留色淺―深，細(xì)胞壁殘留物少―較多，細(xì)胞形態(tài)主要從石英、玉髓、蛋白石交代、充填、堆積形成的細(xì)胞輪廓及明顯的細(xì)胞壁判斷。各樹種均有。
　　受CuC03浸染，使木化石呈顯綠色�？兹甘�呈薄膜狀附著于木化石表面及裂隙中，在木化石中常成片分布，也呈斑塊狀、花斑狀出現(xiàn)。
　　3、瑪瑙狀木化石
　　曾有報導(dǎo)一種“瑪瑙木化石”，這在自然界是不存在的，在成因上大相徑庭。當(dāng)結(jié)晶致密細(xì)膩的玉髓木化石被后期氧化鐵質(zhì)浸染，有時氧化鐵質(zhì)浸染依附于年輪展布，外貌酷似瑪瑙，將這種具有玉石質(zhì)地的木化石，可稱為“瑪瑙狀木化石”。
　　最近筆者檢測了一批“瑪瑙狀石英玉髓木化石”有紅色、褐紅色、淺褐黃色、乳白色、墨黑色、灰色，亦有幾種顏色混合或有規(guī)律分布，由于硅化作用強烈，木質(zhì)纖維細(xì)胞結(jié)構(gòu)殘存極少，有的局部可見環(huán)狀年輪、細(xì)胞的形貌，拋光后細(xì)膩光潤，玉石感極強，多由石英、玉髓礦物組成，但形似瑪瑙而非瑪瑙。
　　瑪瑙在礦物、巖石學(xué)中賦于特定的定義和形成機(jī)理，瑪瑙是一種分泌體，是在一定的空間中(多呈圓形)，自外向內(nèi)生長結(jié)晶而成，結(jié)晶充填整個空腔。分泌體的典型特征為同心層狀條帶的色環(huán)，系分泌作用過程中，SiO2凝膠在空穴中緩緩沉淀結(jié)晶而成，有的在中心空腔的壁上生長著石英晶簇。在木化石中或與圍巖接觸部位，若存在一定的孔隙、空洞，也可形成局部的瑪瑙結(jié)晶，但從整個樹干而言，它不具備瑪瑙形成的地質(zhì)環(huán)境。
　　瑪瑙多產(chǎn)于火山巖的氣孔中；沉積巖中硅質(zhì)巖的空穴處；熱液石英脈的石英晶簇的壁端。在云南、貴州、四川三省交界處近五十萬平方公里上，分布著二疊紀(jì)峨眉山玄武巖，在一種氣孔狀玄武巖內(nèi)，氣孔中的充填物為各種顏色的瑪瑙，雨花石大多數(shù)也屬瑪瑙，巴西盛產(chǎn)的紫晶晶簇洞中，在其壁端分布著條帶狀瑪瑙。